首都醫科大學實驗動物部，是以實驗動物資源供給、動物實驗技術服務工作為中心，同時開展教學、科研工作的綜合部門。
實驗動物部現有實驗動物設施6000M2。其中，屏障環境4700M2，普通環境1300M2。屏障環境可開展清潔級大小鼠飼養及動物實驗，并對國內外實驗動物引進及轉基因動物進行保種。普通環境可開展猴、小型豬、比格犬、普通級兔和豚鼠等普通級動物的飼養，具有數字化凈化手術室和多種實驗儀器。
技術服務工作內容有：①常規動物實驗；②大動物實驗外科及實驗研究；③人類疾病動物模型研制（腫瘤動物模型、腦卒中模型、AD、糖尿病模型、肝硬化等）；④實驗動物病理技術（動物病理切片制備、閱片及診斷）；⑤實驗動物行為學實驗；⑥實驗動物基因修飾（轉基因動物制備、胚胎冷凍）等。
實驗動物學科是我校的特色學科，在教育與培訓方面開展了多層次的實驗動物學的專業和繼續教育。在科研方面承擔多項科研課題，十一五期間共主持科研課題20余項。
實驗動物部依托學校相關學科的技術資源，以實驗動物學科建設成果為支持，整合首醫系統實驗動物資源，加強國內外有實力單位的合作，立足首都、服務全國。
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